Хакнэ Пони были выведены во второй половине восемнадцатого века – до этих пор термин «пони хакнэ» почти всегда относился к низкорослым лошадям с примесью породы Хакнэ. Выведение настоящей породы пони хакнэ является заслугой исключительно предприимчивого коневода из Уэстморленда Кристофера Уиндхэма Уилсона, замечательного человека, замечательного человека, в число достижений которого входит изобретение силоса для зимнего кормления скота. За основу Уилсон взял кобыл нескольких пород пони, в особенности феллов, скрещивая их с симпатичным хакнэ по кличке Сэр Джордж, 1866 года рождения, имевшим рост менее 142 см. Стратегия разведения «в себе» с помощью плодовитого Сэра Джорджа принесла Уилсону успех в деле выведения хакнэ с типичными чертами пони, и с течением времени другие селекционеры последовали его примеру. Первоначальный лимит роста для пони составлял 147 см, но по рекомендации Общества пони хакнэ был впоследствии снижен до 142 см. Знаменитый высокий шаг хакнэ приобрели лишь во второй половине девятнадцатого века, когда появилась мода править элегантными выездами экипажных упряжек. Это качество частично наследственное, частично привито в процессе тренировки.
Масть у Хакнэ Пони обычно тёмно-бурая, гнедая или рыжая. Высота в холке не выше 142 см.